Publications en libre accès

Comment rendre vos vieux articles disponibles en open access?

Le mouvement vers l'"open access" (libre accès) se propage dans la communauté scientifique, afin que les résultats de la recherche soient disponibles à tous, et ce gratuitement. En effet, les éditeurs de revues scientifiques utilisent principalement un modèle de "pay-wall", l'utilisateur devant payer, autour de >30$US, pour seulement pouvoir lire un article. Présentement, les bibiothèques universitaires paient des abonnements, ce qui permet à la communauté universitaire d'avoir un accès à un certain nombre de revues, dépendamment des budgets disponibles. Récemment, même les plus grandes universités comme Harvard dénoncent ces couts prohibitifs¹. Les scientifiques eux-mêmes désirent de plus en plus que leurs recherches circulent librement alors que les organismes subventionnaires qui financent la recherche à partir de fonds publics exigent maintenant que les publications scientifiques soient disponibles à tous (généralement sous un délai maximal de 12 mois).

Toutefois qu'advient-il des publications publiées depuis plusieurs années?

Il est toutefois possible de les rendre disponible sans enfreindre les ententes de copyright signées, voici comment:

1. Faire une recherche sur Romeo afin de connaitre les politiques spécifiques au journal dans lequel votre article a été publié.
2. Vous y verrez ceci:
   
   Dans la majorité des cas, vous apprendrez que vous pouvez archivez une version personnelle (author can archive post-print (ie final draft post-refereeing)), c'est-à-dire le texte qui a été accepté après la revision par les pairs, mais sans la mise en page (le fichier pdf), la "valeur ajoutée" de l'éditeur. Il est bon de contre-vérifier sur le site de la revue/éditeur, pour savoir s'il des conditions plus spécifiques (souvent une période d'embargo variant de 6 à 36 mois).
3. Utilisez votre texte (souvent en format .doc) que vous aviez sauvegardé dans vos archives personnelles. Si vous ne l'avez pas sous la main:
   1. Récupérer le texte sur le site de l'éditeur (parfois disponible en version html), le copier dans un éditeur de texte
   2. Extraire le texte directement à partir du fichier pdf avec un outil comme celui-ci
   Dans tous les cas, il est fort probable que vous ayez à faire du nettoyage et de la mise en forme afin de rendre le document lisible. Attention, vous devez généralement ajouter une mention telle que "Final publication is available at http...". Profitez-en pour y ajouter la référence complète afin d'aider vos lecteurs à vous citer correctement. Convertissez-le en pdf pour être certain que votre mise en page soit maintenue.
4. Trouver un répertoire où vous pourrez télécharger votre article. La plupart des universités en mettent à la disposition de leurs professeurs et étudiants (dans notre cas, papyrus). Sinon, effectuez une recherche sur ce site.

Ces répertoires sont perennes et vous fournissent une adresse doi que vous pourrez disséminer, que ce soit sur votre site web, vos CV, les réseaux sociaux ou les sites comme Mendeley et ResearchGate.

Quelques heures bien investies qui profiteront à l'ensemble de la communauté scientifique!

¹Harvard University says it can't afford journal publishers' prices

Lecture complémentaire sur le mouvement open access

• Nature 495, 426–429, The cost of knowledge doi:10.1038/495426a
• Dossier sur Science Presse
• Budapest Open Access Initiative (anglais)
• Le mouvement d'open science
• Politique d'accès libre des IRSC

Les articles disponibles :

• Bosoi C et al., 2012, Free Radic Biol Med, Systemic oxidative stress is implicated in the pathogenesis of brain edema in rats with chronic liver failure.
• Rose C, 2010, Neurochem Int, Increase brain lactate in hepatic encephalopathy: Cause or consequence?
• Kristiansen R et al., 2010, Scand J Gastroenterol, Neuropathological changes in the brain of pigs with acute liver failure.
• Yang X et al., 2010, Metab Brain Dis, Portacaval anastomosis-induced hyperammonemia does not lead to oxidative stress.
• Bosoi C et al., 2009, Metab Brain Dis, Identifying the direct effects of ammonia on the brain.
• Chatauret N et al., 2006, J Hepatol, Direct molecular and spectroscopic evidence for increased ammonia removal capacity of skeletal muscle in acute liver failure.
• Sen S et al., 2006, Crit Care Med, Effect of albumin dialysis on intracranial pressure increase in pigs with acute liver failure: a randomized study.
• Ytrebø L et al., 2006, Scand J Gastroenterol, Systemic and regional hemodynamics in pigs with acute liver failure and the effect of albumin dialysis.
• Bélanger M et al., 2005, J Hepatol, Mild hypothermia prevents brain edema and attenuates up-regulation of the astrocytic benzodiazepine receptor in experimental acute liver failure.
• Rose C et al., 2005, J Biol Chem, Acute insult of ammonia leads to calcium-dependent glutamate release from cultured astrocytes, an effect of pH.
• Vaquero J et al., 2005, J Hepatol, Keeping cool in acute liver failure: rationale for the use of mild hypothermia.
• Jalan R et al., 2004, Metab Brain Dis, Hypothermia in acute liver failure.
• Ytrebø L et al., 2004, Scand J Gastroenterol, Contractile response of femoral arteries in pigs with acute liver failure.
• Zwingmann C et al., 2004, Brain Res, Selective alterations of brain osmolytes in acute liver failure: protective effect of mild hypothermia.
• Chatauret N et al., 2003, Gastroenterology, Effects of hypothermia on brain glucose metabolism in acute liver failure: a H/C-nuclear magnetic resonance study.
• Desjardins P et al., 2003, Neurochem Int, Induction of astrocytic cyclooxygenase-2 in epileptic patients with hippocampal sclerosis.
• Chatauret N et al., 2002, Metab Brain Dis, Mild hypothermia in the prevention of brain edema in acute liver failure: mechanisms and clinical prospects.
• Rose C, 2002, Metab Brain Dis, Increased extracellular brain glutamate in acute liver failure: decreased uptake or increased release?
• Sauvageau A et al., 2002, Metab Brain Dis, Increased expression of "peripheral-type" benzodiazepine receptors in human temporal lobe epilepsy: implications for PET imaging of hippocampal sclerosis.
• Chatauret N et al., 2001, Metab Brain Dis, Mild hypothermia prevents cerebral edema and CSF lactate accumulation in acute liver failure.
• Desjardins P et al., 1999, Metab Brain Dis, Effect of portacaval anastomosis on glutamine synthetase protein and gene expression in brain, liver and skeletal muscle.
• Layrargues G et al., 1998, Metab Brain Dis, Role of manganese in the pathogenesis of portal-systemic encephalopathy.
• Rose C et al., 1998, Metab Brain Dis, L-ornithine-L-aspartate in experimental portal-systemic encephalopathy: therapeutic efficacy and mechanism of action.
• Knecht K et al., 1997, Neurosci Lett, Decreased glutamate transporter (GLT-1) expression in frontal cortex of rats with acute liver failure.